公元年，隆庆帝驾崩，年仅十岁的朱翊钧继位，次年改元万历，司礼监掌印太监冯保紧紧抓住这个宝贵时机，借李太后的手成功驱逐当时内阁首辅也就是自己的宿敌高拱。于是张居正顺理成章地成为万历朝内阁首辅。
这时候的国家处于江河日下，《明史》记载当时的情形为“曰宗室骄恣,曰庶官疾旷,曰吏治因循,曰边备未修,曰财用大亏”，国家到处于危险的边缘。
张居正因为推行考成法所以非常严格，在朝廷上小万历读书的地方，特意制作了十二面大屏风，每个屏风上写了各地官员主要名单，把全国分为十二个大行*区，贴在上面，每十天一换。给小皇帝看全国官员变动情况，也表达了张居正要锐意改革的决心。张居正主*的十年里面总共撤掉九品以上官员两千多人，所以可以理解为什么有那么多人攻击张居正。
御史傅应祯上表给小万历皇帝说“张居正是又一个王安石，宋代之所以最后内耗掉根源就是王安石的那场变法上，如果让他继续推行新*，我们大明朝就要走宋朝的老路”。
对于他人攻击张居正向来不屑一顾，对于考成法丝毫不犹豫，尤其注意以身作则，他所提拔的学生下属部旧也要求的很严格，张居正有个学生叫刘台，是隆庆五年的进士，当时的主考官正好是张居正，就这样算成为他的学生了，一开始上面安排刘台在湖北江陵县做县令，这里是张居正老家，刘台就去找张居正他父亲张文明拍他马屁，想搭上首辅这条线。
时间长了他父亲给张居正写家信的时候就会提到刘台这个人，在当地做官的名声多好人也好。张居正也注意到考成簿上他的*绩也不错，值得提拔。万历三年的时候刘台当上了辽东巡按。这个官很大也很重要，在这个位置上没多久辽东发生了大战，名将李成梁和蒙古族后裔泰宁部落混战，李成梁大胜。
刘台写了一篇表彰送到内阁，但是他忘记了他是监督行*官员的，没有权利干预*事，严格说起来就是越权了，他心里很清楚这一点，但是又认为这是好事啊。张居正拿到这表彰勃然大怒，为了给官场上敲响一个警钟，所以上奏小万历请皇上圣谕斥责刘台，虽然没有降级，但是刘台脸面丢尽。
这件事刘台念念不忘，虽然他很聪明很能干但是心眼也小。这时候傅应祯又上疏功绩张居正，说他的考成法追缴欠税，搞得民不聊生。这关系到改革的根本利益，张居正上奏万历皇帝把傅应祯革职查办发配充*，彻查此事。而刘台和傅应祯是好友。
就这样刘台又想到之前的事件，认为张居正是要对自己下手，刘台铤而走险弹劾当朝首辅张居正，自大明朝以来从未有过学生弹劾老师的先例，而且说的都是要害，写道“欺世盗名改变监察系统结*营私山泉自用苛*猛于虎贪污腐败”。
既然张居正为官清廉。刘台却着重弹劾他贪污，因为刘台清楚他父亲张文明但凡有人送礼他都照单全收。所以张居正万般无奈向万历请求辞职，李太后小万历掌印太监冯保都慌乱了，这时候万历十四岁，看到母亲李太后为此事都哭得稀里哗啦，三个人都求着张居正不要辞职，接连上三篇辞职，对于刘台，万历派太监到内阁传口谕“刘台谗言乱*，张责一百，发配充*”。
张居正坚持辞职也是有原因的，这件事第一毕竟是明朝第一例学生弹劾老师，再者可能也意识到自己这几年位高权重。后来张居正还是复职了，几次上疏请太后和皇上原谅刘台，最后被削职为民。张居正因此认清他的改革只能进不能退。